2008年4月3日,公司前身深圳市水务规划设计院成立。 2015年6月8日,公司名称由“深圳市水务规划设计院”变更为“深圳市水务规划设计院有限公司”。 2019年1月16日,公司名称由“深圳市水务规划设计院有限公司”更名为“深圳市水务规划设计院股份有限公司”。