2012年8月3日,南京大學環境規劃設計研究院有限公司成立。 2017年6月7日,有限公司整體變更爲南京大學環境規劃設計研究院股份公司。 2020年10月,公司名稱由“南京大學環境規劃設計研究院股份公司”更名爲“南京大學環境規劃設計研究院集團股份公司”。