公司前身爲科學出版社,由中國科學院編譯局與龍門書局於1954年8月合併成立,爲中科院所屬事業單位。1998年12月25日經中科院《關於同意申辦科學出版社營業執照的批覆》(企字[1998]146號)文件批覆,科學出版社於1999年4月15日成立。2007年3月29日,科學出版社改製爲一人有限責任公司,公司更名爲科學出版社有限責任公司。2011年5月12,整體變更設立股份公司,2011年6月15日,公司名稱變更爲“中國科技出版傳媒股份有限公司”。
