公司是於1999年12月經新疆維吾爾自治區人民政府新政函[1999]192號文批准,由新疆生產建設兵團農業建設第二師二十八團、新疆生產建設兵團農業建設第二師二十九團、新疆生產建設兵團農業建設第二師三十團、新疆庫爾勒農墾供銷合作總公司(現變更爲新疆生產建設兵團農二師永興供銷有限責任公司)、新疆農墾庫爾勒物資總公司(現變更爲新疆生產建設兵團農二師天潤農業生產資料有限責任公司)共同發起設立,於1999年12月30日註冊登記成立。 經中國證券監督管理委員會<關於覈准新疆冠農果茸股份有限公司公開發行股票的通知>(證監發行字[2003]46號)覈准,公司於2003年5月26日公開向社會發行人民幣普通股4000萬股。 2018年11月14日,公司名稱由“新疆冠農果茸集團股份有限公司”變更爲“新疆冠農果茸股份有限公司”,同時英文名稱由“Xinjiang Guannong Fruit&Antler Group Co.,Ltd.”變更