南京证券股份有限公司系由南京市证券有限责任公司整体变更设立,南京市证券有限责任公司的前身为成立于1990年11月23日的南京市证券公司。1999年8月3日更名为南京市证券有限责任公司。 2012年9月21日,南京证券有限责任公司更名为南京证券股份有限公司。
